Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01789 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01789 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01789 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01789 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01789 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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