Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms