Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CrxO54751 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CrxO54751 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms