Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited2O35740 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cited2O35740 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cited2O35740 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms