Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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