Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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