Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clk2O35491 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clk2O35491 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Clk2O35491 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk2O35491 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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