Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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