Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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