Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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