Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hps1O08983 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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