Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms