Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PrkcshO08795 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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