Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MttpO08601 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MttpO08601 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MttpO08601 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms