Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm3278L7N2D2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3278L7N2D2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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