Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm2056J3QQ02 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm2056J3QQ02 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm2056J3QQ02 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2056J3QQ02 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm2056J3QQ02 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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