Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930544D05RikJ3QK56 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms