Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem200cJ3QK46 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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