Protein–RNA interactions for Protein: G8JL69

Gm11027, Predicted gene 11027, mousemouse

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Length 66 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11027G8JL69 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm11027G8JL69 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm11027G8JL69 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm11027G8JL69 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm11027G8JL69 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm11027G8JL69 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm11027G8JL69 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm11027G8JL69 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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