Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp72F8VQC1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Srp72F8VQC1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp72F8VQC1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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