Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Speer4aF8VPX6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms