Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10378F6XQQ1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms