Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms