Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gm3250E9Q1M3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Gm3250E9Q1M3 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Gm3250E9Q1M3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm3250E9Q1M3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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