Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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