Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt78E9Q0F0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms