Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ddx60E9PZQ1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms