Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srp54bE9PXC0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms