Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3002E9PW72 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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