Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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