Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms