Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia4B8QI36 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia4B8QI36 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms