Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms