Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfap58B2RW38 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms