Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apol7aB2RT54 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms