Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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