Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brpf1B2RRD7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms