Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp42B2RQC2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp42B2RQC2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp42B2RQC2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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