Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms