Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms