Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Grik3B1AS29 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Grik3B1AS29 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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