Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Prr16A3KMN5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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