Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ambra1A2AH22 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms