Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Crlf3Q9Z2L7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Crlf3Q9Z2L7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms