Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd2Q9Z2E1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd2Q9Z2E1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd2Q9Z2E1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms