Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn6Q9Z262 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn6Q9Z262 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn6Q9Z262 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn6Q9Z262 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn6Q9Z262 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn6Q9Z262 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms