Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccne2Q9Z238 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne2Q9Z238 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne2Q9Z238 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms