Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf394Q9Z1D9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf394Q9Z1D9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf394Q9Z1D9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms