Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tusc2Q9WVF8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tusc2Q9WVF8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tusc2Q9WVF8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms