Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ArcQ9WV31 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ArcQ9WV31 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ArcQ9WV31 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms